L’attuale stemma dell’Ente è stato realizzato nel 1929, il colore rosso dell’attuale gonfalone ricorda il martirio di S. Bartolomeo patrono del castello di Montecchio, contornano lo stemma la denominazione dell’Ente e lo stemma dell’antico Comune di Montecchio con i tre monti sovrastati da una stella a sei punte. Pertanto possiamo descrivere il gonfalone come un drappo rosso orlato in oro a tre punte angolari rientranti con cima frangiata in oro, in capo sei asole per traversa, fiocco tricolore, cordoncino e nappe oro, asta con l’ancia, traversa con pomoli.
Al centro del drappo lo stemma dell’Università Agraria: scudo sannitico moderno, smalto oro, in campo quattro attrezzi agricoli intersecati e serrati da fiocco (falce fienaia, vanga, zappa, vomere-voltarecchia con relativo fendente su vite senza fine).
Lo stemma è sormontato da scritta lineare in oro su tre righi correnti.
UNIVERSITA’ AGRARIA DI MONTECCHIO 1899